菏泽医学专科学校附属医院(简称菏医附院)是一所公立非营利性二级综合性医院，菏泽市职工及城乡居民医保定点医院。
      现有内科、外科、妇科、眼科、菏泽市青少年低视力防治中心、康复医学科、口腔科、皮肤科、中医科（包括针灸推拿）、手术室和麻醉科、血液透析室、预防保健科（包括体检）、医学检验科、超声科、放射科、心电图室、内镜室等科室。
      眼科和呼吸内科为全国委员单位。眼科和康复科为重点学科。眼科技术力量雄厚，设备先进，集医疗、科研、教学、预防于一体，是全国眼免疫学、眼遗传学委员单位。眼科由省内知名专家杨朝忠教授、王勇教授领衔，拥有进口蔡司眼科手术显微镜、准分子激光+飞秒激光治疗仪、视网膜--脉络膜造影--OCT一体机、白内障超声乳化仪等近3000万元的高端仪器设备，全面开展了白内障超声乳化联合人工晶体植入术、各种角膜移植、玻璃体切除术、准分子-飞秒激光治疗近视、远视和散光、青光眼防治、眼免疫病防治、眼遗传病防治、斜视弱视防治、眼科整形美容、中西医结合糖尿病视网膜病变等复杂疑难病防治。同时成立了菏泽医专眼科研究所、青少年低视力防控中心、眼科生物材料研发中心。目前正承担山东省科技厅科技惠民计划项目，实施“青少年近视多元化防控方案应用研究及示范推广”工作。医院青少年低视力防治中心配置日本进口综合验光仪及全套进口配镜加工设备，可实时配戴角膜接触镜和角膜塑形镜，角膜塑形镜的开展填补了我市的空白。
      微创外科和妇科手术是医院的特色。呼吸内科设立呼吸病门诊、病房、慢阻肺康复室、肺功能室和睡眠呼吸监测室，以肺部感染、慢阻肺、哮喘、胸膜疾病、肺栓塞、睡眠呼吸障碍和肺癌的生物治疗等为特色。消化内科拥有电子胃镜、肠镜及胶囊内镜，全消化道检查无盲区，可以充分完整观察食道、胃、结肠及小肠内病变，并可进行消化道息肉切除、消化道狭窄扩张、支架植入等治疗。中医科除传统中医药治疗各种疾病外，中药鼻腔冲洗治疗各种鼻炎尤为突出。针灸理疗科开展了针灸、推拿、理疗、灸疗等，近期引进德国史托斯冲击波治疗仪，对各种软组织疼痛具有较好的治疗效果。口腔科引进了口腔全景机等先进设备，开展了口腔内科、牙齿种植、镶复和正畸等工作。血透室20张血透床位，配备全套进口设备，可为慢性肾衰竭患者提供良好的治疗服务。皮肤科对常见和疑难皮肤病诊治有较高水平。
      “一切为了病人”是菏泽医专附属医院对患者永远的承诺，医院将以严谨的治学态度、精湛的医疗技术、优质高效的服务、规范合理的收费为患者提供满意、放心的服务。